Ql

1) D. J. C. Pappin, P. Hojurup, A. J. Bleasby, Curr. Biol., 3, 327 (1993).

2) M. Mann, P. Hojurup, P. Roepstorff, Biol. Mass Spectrom., 22, 338 (1993).

3) W. J. Henzel, T. M. Billeci, J. T. Stults, S. C. Wong, C. Grimley, C. Watanabe, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5011 (1993).

4) P. James, M. Quadroni, E. Carafoli, G. Gonnet, Biochem. Biophys. Res. Commun.,195, 58 (1993).

5) J. R. Yates III, S. Speicher, P. R. Griffin, T. Hunkapiller, Anal. Biochem., 214, 397 (1993).

6) P. James, M. Quadroni, E. Carafoli, G. Gonnet, Protein Sci., 3, 1347 (1994).

7) T. Kosaka, T. Takazawa, T. Nakamura, Anal. Chem., 72, 1179 (2000).

8) M. W. Senko, J. P. Speir, F. W. MacLafferty, Anal. Chem., 66, 2801 (1994).

9) M. Mann, M. S. Wilm, Anal. Chem., 66, 4390 (1994).

10) B. Blagoev, I. Kratchmarova, S-E. Ong, M. Nielsen, L. J. Foster, M. Mann, Nature Biotechnol., 21, 315 (2003).

11) T. P. Conrad, K. Alving, T. D. Veenstra, M. E. Belov, G. A. Anderson, D. J. Anderson, M. S. Lipton, L. Pasa-Tolic, H. R. Udseth, W. B. Chrisler, B. D. Thrall, R. D. Smith, Anal. Chem., 73, 2132 (2001).

12) T. C. Hunter, L. Yang, H. Zhu, V. Majidi, E. M. Bradbury, X. Chen, Anal. Chem., 73, 4891 (2001).

13) S. E. Ong, B. Blagoev, I. Kratchmarova, D. B. Kristensen, H. Steen, A. Pandey, M. Mann, Mol. Cell. Proteomics, 1, 376 (2002).

14) X. Chen, L. M. Smith, E. M. Bradbury, Anal. Chem., 72, 1134 (2000).

15) H. Zhu, T. C. Hunter, S. Pan, P. M. Yau, E. M. Brudbury, X. Chen, Anal. Chem., 74, 1687 (2002).

16) S. Martinovic, T. D. Veenstra, G. A. Anderson, L. Pasta-Tolic, R. D. Smith, J. Mass Spectrom., 37, 99 (2002).

17) S. P. Gygi, B. Rist, S. A. Gerber, F. Turecek, M. H. Gelb, R. Aebersold, Nature Biotechnol., 17, 994 (1999).

18) D. K. Han, E. J. Zhou, R. Aebersold, Nature Biotechnol., 19, 946 (2001).

19) L. R. Yu, M. D. Johnson, T. P. Conrads, R. D. Smith, R. S. Morrison, T. D. Veenstra, Electrophoresis, 23, 1591 (2002).

20) H. Lee, T. J. Griffin, S. P. Gygi, B. Rist, R. Aebersold, Anal. Chem., 74, 4353 (2002).

21) R. Zhang, C. S. Sioma, R. A. Thompson, L. Xiong, F. E. Regnier, Anal. Chem., 74, 3662 (2002).

22) http://www.applied biosystems.com

23) H. Zhou, J. A. Ranish, J. D. Watts, R. Aebersold, Nature Biotechnol., 20, 512 (2002).

24) Y. Qui, E. A. Sousa, R. M. Hewick, J. H. Wang, Anal. Chem., 74, 4969 (2002).

25) M. Munchbach, M. Quadroni, G. Miotto, P. James, Anal. Chem., 72, 4047 (2000).

26) D. R. Goodlett, A. Keller, J. D. Watts, R. Newitt, E. C. Yi, S. Purvine, J. K. Eng, P. von Haller, R. Aebersold, E. Kolker, Rapid Commun. Mass Spectrom., 15, 1214 (2001).

27) S. Wang, X. Zhang, F. E. Regnier, J. Chromatogr., A 949, 153 (2002).

28) D. Figeys, Curr. Opin. Mol. Ther., 4, 210 (2002).

29) D. R. Muller, P. Schindler, H. Towbin, U. Wirth, H. Voshol, S. Hoving, M. O. Steinmetz, Anal. Chem., 73, 1927 (2001).

30) A. Borodovsky, H. Ovaa, N. Kolli, T. Gan-Erdene, K. D. Wilkinson, H. L. Ploegh, B. M. Kessler, Chemstry & Biology , 9, 1149 (2002).

31) Y. Oda, T. Nagasu, B. T. Chait, Nature Biotechnol., 19, 379 (2001).

32) T. Sonoda, S. Shigaki, T. Nagashima, O. Okitsu, Y. Kita, M. Murata, Y. Katayama, Bioorg. Med. Chem. Lett., 14, 847 (2004).