遺伝子工学の発展に伴い、数十年前までは極めて特別なものであった核酸を用いた実験も比較的容易に出来るようになってきた。しかし、自然界には核酸を分解する酵素が多く含まれるために、通常の実験で用いるような緩衝液では、目的の核酸を分解させてしまう危険性が潜んでる。今回、弊社が提供する緩衝液は、ろ過滅菌とオートクレーブ処理をすることにより、核酸を分解する酵素(DNase, RNase)の検出されない緩衝液である。発売する10種の緩衝液はストック溶液であり、使用時に混合もしくは希釈する。希釈する精製水も必要に応じオートクレーブ処理したものを使用すると良い。
MESAはRNAの検出サイズ決定などを行うNorthern Blottingに用いる。Northern Blottingとは変性アガロースゲル電気泳動によって分画したRNAをゲルによりニトロセルロース膜などに吸着させる方法である。その他RNAの分子量決定などの電気泳動に対してもよく使用されている緩衝液である。RNAの取り扱いは特に注意深く行われるべきであり、希釈する精製水はオートクレーブ処理したものを使用する。また0.1％二炭酸ジエチルを添加してオートクレーブ処理したものはRNaseを不活性化すると言われており、この精製水はRNA実験に多く用いられているため、MESAの希釈にもこの精製水を用いることを勧める。
TAE, TBE, TPEは核酸、特にDNAの電気泳動に用いる。TAEはアガロースゲル電気泳動に用いることが多く、TBE, TPEはアクリルアミドゲル電気泳動に用いることが多い。これらの電気泳動は核酸のサイズで使い分けされ、一般に1kb以上をアガロースゲル電気泳動、1kb以下をアクリルアミドゲル電気泳動を使用する。
SSC, SSPEはSouthern hybridizationに使用する緩衝液である。Southern hybridizationは1975年にSouthernによって確立された方法である。アガロースゲルで泳動したDNA断片をニトロセルロース膜などに吸着させる。プローブを用いて、プローブと同一もしくは類似の塩基配列をもつ部位を同定する方法である。現在、汎用されている方法の一つである。
TE, TNEは電気泳動のゲルや動物組織、細胞よりDNAを抽出、精製するのに用いられる。このDNAの抽出、精製は、DNAライブラリー作成や、より良いSouthern hybridizationを行うためには、高純度かつ長いDNAを必要とする。しかし、長鎖のDNAは物理的にも切断されるので取り扱いは慎重に行われるべきである。
Reference
J. Sambrook, E. F. Fritsch, T. Maniatis,“Molecular Cloning: A Laboratory Manual”，2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory New York, 1989.